對于超時工作的員工，公司可以通過罰款的方式來懲罰他們。罰款金額可以根據超時工作的時間和頻率來確定，一般為員工日薪的百分之幾。

2.扣除獎金

如果員工超時工作，導致公司產生了額外的成本，公司可以通過扣除員工的獎金來彌補這些成本。扣除獎金的數額應該與超時工作的時間和頻率成正比。

3.調整工資

如果員工超時工作成為了一種常態，公司可以通過調整員工的工資來懲罰他們。調整的幅度應該與超時工作的時間和頻率成正比。

如果員工的超時工作已經嚴重影響了公司的正常運營，公司可以考慮對其進行停職處罰。停職的時間可以根據超時工作的嚴重程度來確定。

如果員工的超時工作已經嚴重影響了公司的正常運營，甚導致了重大損失，公司可以考慮對其進行解雇處罰。解雇應該是的手段，只有在情況非常嚴重的情況下才應該采取。

總之，超時工作雖然能夠帶來一定的收益，但是也會給員工和公司帶來一系列的負面影響。因此，公司應該采取一些處罰措施來規范員工的工作行為，保證公司的正常運營。同時，員工也應該自覺遵守公司的規定，保護自己的身心健康。