違法診所的處理應該根據法律法規，有序地進行處理，以保證患者的安全和權益。違法診所的處理包括：查處違法行為、整改措施、強制關閉、罰款處罰等，必要時可以對違法者依法追究刑事責任。

1．查處違法行為

對于違法診所的違法行為，應當依法查處，依據《中華人民共和國醫療機構管理法》等法律法規，對違法診所的違法行為進行查處。

2．整改措施

對于違法診所，應當依法采取整改措施，要求其采取有效措施，改正違法行為,并建立有效的管理制度，確保未來不再出現違法行為。

3．強制關閉

對于違法診所，有可能采取強制關閉的措施，當違法診所有重大違法行為，或者存在嚴重危害社會安全的情況，應當采取強制關閉的措施，以保護患者的安全。

4．罰款處罰

對于違法診所，應當依法處以罰款，根據《中華人民共和國醫療機構管理法》等法律法規，對違法診所的違法行為處以罰款，以保證患者的權益。

5．追究刑事責任

對于違法診所，必要時應當依法追究刑事責任，當發現有嚴重違法行為，或者存在嚴重危害社會安全的情況，應當依法追究其刑事責任，以維護社會公共利益。

綜上所述，違法診所的處理應當依法進行，應當查處違法行為，采取整改措施，采取強制關閉的措施，處以罰款，必要時追究刑事責任，以維護患者的安全和權益。