農業違法行為是指在農業生產、經營、管理等過程中違反法律、法規、規章和政策的行為。這類行為嚴重影響了農業生產的正常秩序，損害了農民和的利益。因此，對于農業違法行為的處理，需要有明確的流程和注意事項。

一、農業違法案件處理流程

1. 接報案件如果發現農業違法行為，應該及時向當地農業、林業、畜牧、漁業等部門報告，或者向公安機關報案。

2. 立案查處接到報案后，相關部門應當及時組織力量進行調查取證，并對涉嫌違法行為進行立案查處。

3. 制定處罰方案經過調查取證，相關部門應當根據事實情況制定相應的處罰方案。

4. 通知當事人制定處罰方案后，相關部門應當通知當事人，并告知其有權進行申辯和申訴。

5. 處理結果經過申辯和申訴后，相關部門應當依法作出處理結果，并告知當事人。

6. 強制執行如果當事人不服處理結果，可以向上級行政機關或者申請行政訴訟，相關部門應當依法執行強制措施。

二、農業違法案件處理注意事項

1. 依法處理農業違法案件的處理必須依法進行，不得有私心、偏見和不公。

2. 保護當事人權益在處理農業違法案件時，應當保護當事人的合法權益，聽取當事人的申辯和申訴。

3. 嚴格證據要求在立案查處和制定處罰方案時，必須嚴格按照證據要求進行，不能憑空猜測和栽贓陷害。

4. 確定處罰幅度在制定處罰方案時，應當根據違法行為的性質、情節和社會影響等因素，確定處罰幅度。

5. 依法公開透明農業違法案件的處理必須依法公開透明，保障社會公眾的知情權和監督權。

總之，農業違法案件的處理是維護農業生產秩序和保護農民和利益的重要措施。相關部門必須嚴格按照法律法規進行處理，確保公正、公平、公開。同時，也要加強對農業生產經營管理的監督和管理，預防和減少農業違法行為的發生。