超員是指在運營過程中，車輛內的乘客人數超過了車輛的核定載客量。雖然超員現象在公共交通工具中時有發生，但是超員情況嚴重時會對乘客的安全和舒適性造成影響，因此，相關部門對超員行為進行了明確的規定和處罰。

根據《中華人民共和國道路運輸條例》規定，超員的定義為“車輛載人超過核定載人數的情況”，并規定了超員的處罰標準。具體規定如下

1. 載人超過核定載人數10%以下的，處100元以上200元以下罰款；

2. 載人超過核定載人數10%以上的，處200元以上500元以下罰款；

3. 載人超過核定載人數30%以上的，處500元以上1000元以下罰款。

此外，根據《中華人民共和國刑法》第二百八十六條規定，超員行為嚴重危害公共安全的，將被追究刑事責任。

針對超員行為，交通運輸管理部門采取以下方式進行處罰

1. 罰款根據超員情況，處以相應的罰款金額。

2. 扣車在嚴重超員情況下，交通運輸管理部門有權扣留車輛，并責令其整改，直符合相關規定。

3. 暫停運營在超員情況嚴重且存在安全隱患時，交通運輸管理部門可以暫停車輛運營，直整改完畢。

超員行為不僅是違法行為，更是一種危害公共安全的行為。為了保障乘客的安全和舒適性，交通運輸管理部門對超員行為進行了明確的規定和處罰。在乘坐公共交通工具時，我們應該遵守相關規定，不要隨意超員，以免造成不必要的麻煩和危險。